Když jistina společnosti S platí do podnikání peníze, existují značně odlišné daňové důsledky v závislosti na tom, zda je platba považována za půjčku nebo klasifikována jako dodatečný vklad splaceného kapitálu. Splátky úvěru od společnosti S jistině se obecně nepovažují za příjem jistiny. Pokud však byla počáteční platba považována za dodatečný splacený kapitál, mohou být následné platby jistině považovány za výplaty dividend nebo mzdy, které jsou pak zdanitelné vůči jistině a mohou zahrnovat i daně ze samostatné výdělečné činnosti.
Aby byla platba jistiny korporaci S řádně považována za půjčku, vyžaduje Interní výnosová služba (IRS), aby mezi korporací S a zmocnitelem existovala smlouva o bona fide dluhu. Pokud taková dohoda neexistuje, může být půjčka považována za dodatečný splacený kapitál ze strany IRS. Mezi prvky dohody o dluhu v dobré víře patří například:
1) Písemná dohoda nebo směnka mezi korporací S a zmocnitelem
2) Přiměřená úroková sazba účtovaná z úvěru
3) Nějaký druh zajištění úvěru
4) Splátky úvěru
Hlavním tématem v tomto určení je skutečná smlouva o půjčce, která musí být uzavřena, v níž má věřitel, který je v tomto případě také hlavní, veškerou běžnou ochranu externího věřitele. Pokud taková ochrana neexistuje, mohly by být finanční prostředky považovány za „ohrožené“. Je to stejné jako u jakékoli jiné investice nebo příspěvku do obchodního podniku. Z pohledu S-korporace by se příjem peněžních prostředků jistiny měl klasifikovat jako dluh pouze tehdy, pokud existuje skutečná dohoda o dluhu. Pokud ne, přijaté prostředky by měly být ve výchozím nastavení zaznamenány jako dodatečný splacený kapitál.
Vzhledem k tomu, že korporace S jsou průchodnými jednotkami, je daňový dopad čistého zisku nebo ztráty podniku vykázán v jednotlivých daňových přiznáních jistiny. Ředitelé jsou zodpovědní za sledování jejich osobních zásob a dluhových základen v podnikání. Ztráty z převodu společností mohou být odečteny pouze do výše základny, kterou vlastní každý příkazce. Naopak příjem z převodu společnosti přesahující základ je považován za zdanitelný příjem. Přestože samotná korporace S není odpovědná za sledování akciové a dluhové základny svých vlastníků, měla by stále jasně vymezovat kapitálové příspěvky z půjček, aby účetní závěrka ke konci roku byla správná. Jakékoli chyby ve finančních výkazech společnosti S mohou způsobit nesprávnost údajů K-1 vydaných majitelům akcií. Je také životně důležité, aby existovala jasná komunikace mezi vedením společnosti S a hlavní osobou, která do korporace přispívá nebo půjčuje peníze.
